About: Shotgun sequencing   Goto Sponge  NotDistinct  Permalink

An Entity of Type : yago:Technique105665146, within Data Space : wasabi.inria.fr associated with source document(s)

In genetics, shotgun sequencing is a method used for sequencing random DNA strands. It is named by analogy with the rapidly expanding, quasi-random shot grouping of a shotgun. The chain-termination method of DNA sequencing ("Sanger sequencing") can only be used for short DNA strands of 100 to 1000 base pairs. Due to this size limit, longer sequences are subdivided into smaller fragments that can be sequenced separately, and these sequences are assembled to give the overall sequence.

AttributesValues
type
label
  • Shotgun sequencing
  • Shotgun Sequencing
  • Schrotschuss-Sequenzierung
  • Secuenciación de escopeta
  • Sequenciamento Shotgun
  • Shotgun sequencing
  • Séquençage shotgun
  • Метод дробовика
  • ショットガン・シークエンシング法
  • 霰彈槍定序法
  • 샷건 시퀀싱
comment
  • Schrotschuss-Sequenzierung bzw. Shotgun Sequencing ist in der Molekularbiologie eine Methode zur Sequenzierung langer DNA-Stränge. Sie wurde von 1979 bis 1981 entwickelt. Hierbei wird die DNA zunächst zufällig fragmentiert und die resultierenden Fragmente anschließend sequenziert (einige Sequenzierverfahren beinhalten zusätzlich einen Schritt, in dem die DNA vor der Sequenzierung vervielfältigt wird). Unter Anwendung bioinformatischer Methoden wird aus den Fragmenten anschließend die zugrundeliegende DNA-Sequenz rekonstruiert, wobei ein Minimum an Fehlern und Lücken in der Sequenz angestrebt wird.
  • En génétique, le séquençage shotgun (littéralement séquençage "fusil de chasse") est une méthode utilisée pour séquencer des brins d'ADN aléatoires. On l'appelle ainsi par analogie avec le modèle de tir quasi-aléatoire en pleine expansion d'un fusil de chasse : cette métaphore illustre le caractère aléatoire de la fragmentation initiale de l'ADN génomique où l'on "arrose" tout le génome, un peu comme se dispersent les plombs de ce type d'arme à feu. Le séquençage shotgun était l'une des technologies fondatrices à l'origine des projets de séquençage complet du génome.
  • Em genética, o Sequenciamento Shotgun ou Sequenciação Shotgun, também conhecido como Clonagem Shotgun, é um método usado para sequenciamento de fitas longas de DNA. É batizado por analogia com o padrão de fogo de rápida expansão, quase aleatório de uma caçadeira (em inglês: shotgun). O sequenciamento Shotgun foi uma das tecnologias precursoras que foi responsável por possibilitar o .
  • Метод дробовика (англ. Shotgun sequencing) — метод, используемый для секвенирования длинных участков ДНК. Суть метода состоит в получении случайной массированной выборки клонированных фрагментов ДНК данного организма, на основе которых может быть восстановлена исходная последовательность ДНК. Метод дробовика использовался при получении первых полных геномов организмов.
  • En genética, la secuenciación de escopeta o shotgun sequencing es un método utilizado para secuenciar cadenas de ADN aleatorias. Recibe su nombre por analogía con el patrón de disparo cuasialeatorio de rápida expansión de una escopeta. Hay dos métodos principales para este proceso de fragmentación y secuenciación. (o "chromosome walking") progresa a través de toda la hebra pieza por pieza, mientras que la secuenciación rápida es un proceso más rápido, pero más complejo que utiliza fragmentos aleatorios.
  • Seqüenciació (shotgun) és una tècnica de laboratori per a determinar la seqüència del DNA del genoma d'un organisme. El mètode consisteix a trencar el genoma en una col·lecció de petits fragments de DNA que s'ordenen de forma individual. Un programa de computadores busca coincidències en les seqüències de DNA i les utilitza per col·locar els fragments individuals en l'ordre correcte per a reconstruir el genoma.
  • ショットガン・シークエンシング法 は長いDNAの塩基配列の決定に対して適用される配列決定手法。 まず長い配列を短いランダムな断片としてクローニングし、最初にそれらの配列を決定する。このとき一本の長いDNA鎖から沢山のコピーを取り、断片同士がオーバーラップするようにしておく。最終的に、これらのオーバーラップ部分についてコンピュータ上でアライメントを行い、元の長い塩基配列を決定する。 簡略化した例として2本の断片の場合を以下に示す。 元の配列 : XXXAGCATGCTGCAGTCATGCTTAGGCTAXXXX第1回のショットガン配列 : XXXAGCATGCTGCAG TCATGCTTAGGCTAXXXX第2回のショットガン配列 : TTAGGCTAXXXX XXXAGCATGCTGCAGTCATGC再構築された配列 : XXXAGCATGCTGCAGTCATGCTTAGGCTAXXXX
  • 샷건 시퀀싱(Shotgun sequencing)은 유전체 서열 분석 방식의 하나이다. DNA를 잘게 토막 낸 후 염기서열을 분석한 뒤, 이 서열 자료들을 컴퓨터에 넣으면 서로 겹치는 부분을 컴퓨터가 찾아내어 순서를 짜맞춰주는 방식이다.
  • 霰彈槍定序法(Shotgun sequencing,又称鸟枪法)是一种广泛使用的为长DNA测序的方法,比傳統的定序法快速,但精確度較差。曾經使用於塞雷拉基因組(Celera Genomics)公司所主持的人類基因組計畫。 霰彈槍測序法的思想是將基因組打斷為數百萬個DNA片段,然後用一定的演算法將片斷的序列信息重新整合在一起,從而得到整個基因組序列。為了提高這一方法的效率,1980年代,測序和片斷信息整合達到了自動化。這一方法雖然已被用於序列長達6百萬個鹼基對的細菌基因組測序,但對於人類基因組中30億個鹼基對的序列測定,這一技術能否成功在當時還未有定論。
  • In genetics, shotgun sequencing is a method used for sequencing random DNA strands. It is named by analogy with the rapidly expanding, quasi-random shot grouping of a shotgun. The chain-termination method of DNA sequencing ("Sanger sequencing") can only be used for short DNA strands of 100 to 1000 base pairs. Due to this size limit, longer sequences are subdivided into smaller fragments that can be sequenced separately, and these sequences are assembled to give the overall sequence.
sameAs
topic
Faceted Search & Find service v1.13.91 as of Mar 24 2020


Alternative Linked Data Documents: Sponger | ODE     Content Formats:       RDF       ODATA       Microdata      About   
This material is Open Knowledge   W3C Semantic Web Technology [RDF Data]
OpenLink Virtuoso version 07.20.3229 as of Jul 10 2020, on Linux (x86_64-pc-linux-gnu), Single-Server Edition (94 GB total memory)
Data on this page belongs to its respective rights holders.
Virtuoso Faceted Browser Copyright © 2009-2024 OpenLink Software