FASTA is a DNA and protein sequence alignment software package first described by David J. Lipman and William R. Pearson in 1985. Its legacy is the FASTA format which is now ubiquitous in bioinformatics.
FASTA é um pacote de software para alinhamento de seqüências de ADN e proteínas descrito primeiramente (como FASTP) por David J. Lipman e William R. Pearson em 1985. O formato de arquivo definido pelo FASTA é um dos principais formatos utilizados para armazenamento de sequências biológicas.
FASTA は、DNA の塩基配列とタンパク質のアミノ酸配列のシーケンスアラインメントを行うための、バイオインフォマティクスのソフトウェアパッケージである。 FASTA と同様にシーケンスアライメントを行うためのソフトウェアとして、BLAST なども知られる。 最初のバージョンは FASTP という名前であり、デヴィッド・J・リップマンとウィリアム・R・ピアスンが、1985年に開発して論文を発表した。 当初はタンパク質のアミノ酸配列のシーケンスデータベースに対して、アミノ酸配列の類似性 (similarity) の検索を行うように設計された。FASTA の1988年のバージョンでは、DNAの塩基配列の類似性を検索する機能が加えられた。FASTA は FASTP よりも精巧なアルゴリズムで処理を行い、統計上の有意性を評価する。FASTA ソフトウェアパッケージには、タンパク質のアミノ酸配列やDNAの塩基配列のアライメントを行うための、いくつかのプログラムが含まれている。 FASTA は、"FAST-Aye"(ファストエー)と発音する。FASTA は、"FAST-P"(Protein; タンパク質)アライメント と "FAST-N"(Nucleotide; ヌクレオチド)アライメント の総称である、"FAST-All" を意味している。
FASTA est à l'origine un programme d'alignement de séquences d'ADN et de protéine développé par en 1988. Au fil de son développement, il est devenu une suite de programmes, étendant ainsi ses possibilités en termes d'alignement. FASTA est le descendant du programme publié par et en 1985. Un des héritages de ce programme est le format de fichier FASTA qui est devenu un format standard en bioinformatique.
FASTA és un programa informàtic d'alineament d'àcids desoxiribonucleics (ADN) i proteïnes descrit inicialment com a FASTP per i el 1985 en l'article Rapid and sensitive protein similarity searches. Inicialment, el programa original FASTP estava dissenyat per comparar seqüències proteïques, però més endavant, el programa FASTA, descrit el 1988 va afegir la possibilitat de fer cerques ADN:ADN i proteïna:ADN, i va incorporar un mòdul addicional per a càlcular més acuradament el valor estadístic de cada comparació.
Der heuristische FASTA-Algorithmus wurde 1985 von und als FASTP für Proteine entwickelt. Das Programm wurde 1988 auf Nukleotide erweitert. FASTA sucht nach Ähnlichkeiten zwischen Sequenzen oder vergleicht eine gegebene Sequenz mit einer Sequenz-Datenbank. Die Speicherung der Sequenzdaten erfolgt im FASTA-Format. Eine Anwendung findet der Algorithmus beispielsweise beim SIMAP-Projekt.
FASTA je sada programů umožňující alignment (srovnávání) sekvencí DNA a proteinů. FASTA je zkratka od slovního spojení „fast alignment“. FASTA programy za využití rychlých, heuristických metod umožňují vyhledat podobné úseky v sekvencích srovnáváním dotazované sekvence se sekvencemi v proteinových a DNA databázích. Další programy poskytují informace o statistické významnosti alignementu. FASTA se využívá například k odvození funkčních a evolučních vztahů mezi sekvencemi nebo k identifikaci členů genové rodiny.
هذه المقالة هي عن مجموعة برامج فاستا. لأجل صيغة الملف، أنظر صيغة فاستا.فاستا هو مجموعة برامج الحمض النووي والتراصف التسلسلي للبروتين وصفت لأوّل مرّة (FASTP) من قبل في عام 1985.
FASTA es un paquete de software para el alineamiento de secuencias de ADN y proteínas inicialmente descrito como FASTP por David J. Lipman y en 1985. Su legado es el Formato FASTA el cual es ahora muy popular en Bioinformática.
FASTA is a DNA and protein sequence alignment software package first described by David J. Lipman and William R. Pearson in 1985. Its legacy is the FASTA format which is now ubiquitous in bioinformatics.